曾经盛极一时的日本忍者因强迫解散消失无踪。而事实上，忍者至今依旧暗中存在，人数据说多达20万人。部分精锐忍者在国家级的对抗中负责执行秘密任务，相当活跃。不过另一方面，下级忍者却是经常拿不到工作，其中之一的云隐九郎也一样，过着宛如尼特族般的生活...